电子肠镜是由细长而可弯曲的导光纤维管构成，可由肛门送入直肠，以后沿肠道送行，经乙状结肠、降结肠、脾曲、横结肠、肝曲、升结肠、盲肠以至回肠末端。
电子肠镜可完整、仔细地将整个结肠，乃至回肠末端观察清楚，并对可疑部位进行照像、录像及取活组织作病理检查，能及时、准确地对疾病作出诊断，对疾病的早期合理治疗起重要作用。
电子肠镜除可协助诊断外，还可通过肠镜活检孔插入器械对病变部位进行有效的治疗。如化学粒子植入、早期癌肿的激光治疗、息肉的电凝、电切除及激光治疗和局部出血的药物止血等。